当方に専属守護霊付きの立花宗茂がいて、さらに当方の果心居士が敵の先陣武将と軍師武将1名ずつに対して「幻術」を発動した場合、当方の立花宗茂の専属守護霊スキルの補正はどうなりますか？

上記の場合、当方の果心居士の「幻術」スキルにより、敵先陣の武勇と智略を入れ替えた後の武勇値と立花宗茂の武勇値の差で補正値が決まります。
果心居士のスキルの発動タイミングは記載の通り、「戦闘開始前」となっておりますため、「戦闘時」に発動する立花宗茂の守護霊スキルは、その後になります。